Однако 19 мая 2008 года следственный комитет при Брянской областной прокуратуре возбудил против него уголовное дело по признакам превышения полномочий. Поводом к возбуждению уголовного дела по вышеуказанным признакам являются результаты проверки Контрольно-счётной палаты Брянской области в 2007 году.
Согласно акту проверки, в 2005‑2006 годах глава муниципального образования Брянский район С. Н. Кошарный способствовал получению субсидий и приобретению жилья в сельской местности по федеральной целевой программе "Социальное развитие села до 2010 года" ряду лиц.
За три последних года 151 семья района стала участницей вышеназванной федеральной программы. 61 % составляют работники агропромышленного комплекса, 30 % - работники образования и здравоохранения, 9 % - работники ЖКХ и других бюджетных учреждений (это 2 / 3 всех объёмов области).
К тому же в Брянской ЦРБ в посёлке Глинищево недавно построен новый терапевтический корпус, строится поликлиника с административным зданием, введена в эксплуатацию своя автономная котельная. Уровень медицинского обслуживания прельщает не только жителей Брянского района. Построенное жильё и пришедшие профессиональные кадры помогли сохранить районную больницу в дееспособном состоянии.
Подобных примеров в Брянском районе немало. Однако КСП Брянской области имеет на этот счёт иное мнение.
Брянские депутаты повысили зарплаты городским чиновникам 
В Брянске снесли общежитие, не расселив людей 
Ветерану Великой Отечественной войны отказали в жилье 
Хищение 222 тысяч рублей при ремонте школы выявили в Брянской области 
Семья из Брянска добилась внеочередного расселения из аварийного дома